Jakub Benedikt Schikaneder nació el 27 de febrero de 1855 en la ciudad de Praga, dentro de una estructura familiar de ingresos económicos limitados pero vinculada de manera directa al desarrollo cultural centroeuropeo del siglo anterior. Su padre, Karl Schikaneder, se desempeñaba como un empleado administrativo fijo en la oficina de aduanas del Imperio Austrohúngaro en la capital bohemia, una posición burocrática menor cuyos ingresos fijos obligaban a la familia a trasladarse de forma recurrente entre diversas viviendas de alquiler modesto en los barrios antiguos de la ciudad. La ascendencia directa del pintor lo conectaba de forma inmediata con Emanuel Schikaneder, su tío abuelo, quien había ganado notoriedad histórica en Viena como empresario teatral y libretista de la ópera La flauta mágica de Wolfgang Amadeus Mozart, un legado familiar que facilitó la aceptación de la vocación artística del joven Jakub por parte de sus padres.
En el año 1870, tras superar los exámenes de admisión técnica, Schikaneder formalizó su ingreso en la Academia de Bellas Artes de Praga, incorporándose a las aulas en un momento de reorganización curricular bajo la dirección académica del pintor histórico de origen belga Jan Swerts. A lo largo de su formación en la academia praguense, la cual se extendió ininterrumpidamente hasta el año 1878, Schikaneder compartió las jornadas de taller y los proyectos de dibujo del natural con otros jóvenes estudiantes locales como Mikoláš Aleš y František Ženíšek, consolidando redes profesionales que definirían sus primeros contratos públicos. Al concluir este ciclo elemental, las estrecheces financieras de su hogar le obligaron a concursar por fondos externos, obteniendo una beca de viaje de cuantía reducida otorgada por una fundación privada de Praga, lo que le permitió trasladarse a la ciudad de Múnich en el año 1879. Allí se inscribió formalmente en la Academia de Bellas Artes local, pasando a formar parte de los alumnos directos del profesor Gabriel von Max, cuyas lecciones exigían un estricto rigor en el estudio de la anatomía comparada y la reconstrucción documental de acontecimientos históricos.
Durante este período de residencia bávara, Schikaneder coordinó un viaje logístico hacia la ciudad de París, financiado mediante contratos de préstamo privado gestionados por conocidos de su padre en los círculos comerciales de Praga, coincidiendo con la clausura de la Exposición Universal francesa. En la capital gala, centró sus actividades en la inspección detallada del funcionamiento operativo de los talleres independientes y las normativas de admisión de los salones oficiales de exhibición, adquiriendo un conocimiento directo sobre los contratos de distribución y los marcos arancelarios del mercado del arte francés. A su regreso definitivo a Praga a finales de 1880, se enfrentó a la ausencia de un capital inicial propio para el arrendamiento de un taller autónomo, viéndose forzado a subarrendar habitaciones compartidas en el distrito de la Ciudad Vieja para iniciar su producción comercial independiente frente a la competencia de los talleres consagrados de la región.
El año 1881 supuso el inicio de la inserción de Schikaneder en el circuito profesional público de Bohemia al presentarse, en asociación directa con su antiguo compañero de estudios Mikoláš Aleš, al concurso público convocado para la ejecución del programa decorativo monumental del Teatro Nacional de Praga, específicamente para el sector correspondiente al palco real. La propuesta técnica presentada por ambos creadores obtuvo el primer lugar en la licitación oficial, otorgándoles el derecho a un contrato financiero sustancial respaldado por el comité de reconstrucción y por donantes de la aristocracia local, pero el grave incendio que destruyó el edificio en agosto de ese mismo año paralizó por completo la ejecución de las pinturas y desencadenó un prolongado litigio administrativo con los arquitectos jefes sobre la validez de los honorarios devengados. Tras la resolución de estas disputas gremiales, que redujeron de manera considerable su participación final en los muros del teatro a tareas ornamentales menores, Schikaneder concentró su producción en el formato de caballete, logrando la venta de su primera obra de gran relevancia institucional titulada "Clase de dibujo", ejecutada en 1881 y actualmente en una colección privada.
Schikaneder contrajo matrimonio en julio de 1884 con Emílie Pitschová, hija de un asentado comerciante de la ciudad, un enlace que proporcionó una estabilidad económica crucial al hogar gracias a la dote aportada por la familia de la esposa, facilitando el traslado de la pareja a un apartamento de mayores dimensiones en la Ciudad Nueva de Praga. El nacimiento de su único hijo, Leoš Schikaneder, acaecido en el año 1885, se vio seguido por el fallecimiento del niño apenas unos meses después, un hecho que alteró la organización de la vivienda y coincidió con una reorientación de los compromisos contractuales del pintor. Ante la pérdida familiar, intensificó sus vínculos institucionales y ese mismo año aceptó el cargo de asistente docente en la recién establecida Escuela de Artes Aplicadas de Praga, conocida por sus siglas UMPRUM, desempeñando sus funciones bajo la dirección de František Ženíšek en la cátedra especializada de pintura decorativa.
Entre los años 1889 y 1890, Schikaneder dedicó la totalidad de sus recursos económicos y materiales a la preparación de su lienzo más complejo de este período, el cuadro de proporciones monumentales "Asesinato en la casa", adquiriendo los soportes de lino y los pigmentos mediante adelantos comerciales y presentándolo formalmente en la Exposición General del Jubileo de Praga en 1891, una pieza que consolidó de forma definitiva su estatus institucional y que en la actualidad se conserva y exhibe de forma permanente en las salas del Palacio de Ferias de la Galería Nacional praguense tras ser rescatada de la exportación mediante una compra de suscripción pública local.
La consolidación de la trayectoria académica de Schikaneder dentro del sistema administrativo oficial del Imperio Austrohúngaro se ratificó plenamente en el año 1894, fecha en la que el Ministerio de Culto y Educación de Viena aprobó formalmente su nombramiento como profesor titular de la Escuela de Artes Aplicadas de Praga, ocupando la dirección del taller especial de pintura decorativa y dibujo tras la salida de Ženíšek. Este nombramiento le garantizó el cobro de un salario estatal fijo regulado, el acceso a derechos de jubilación civil y el manejo autónomo de un presupuesto institucional anual destinado al mantenimiento del taller escuela, donde implantó un método pedagógico estricto basado en el dibujo de precisión arquitectónica y la preparación química de aglutinantes orgánicos. En este ámbito docente, Schikaneder controló directamente la formación técnica de una amplia promoción de pintores checos, figurando entre sus alumnos directos artistas como Jan Honsa, Alois Kalvoda y Emanuel Frinta, para quienes gestionaba de manera regular becas de estudio oficiales ante las autoridades de la gobernación de Bohemia.
Coincidiendo con este período de solvencia económica continua, el pintor trasladó su residencia familiar fija a un edificio de apartamentos en el distrito de Vinohrady, sosteniendo un contrato de arrendamiento a largo plazo que incluía una gran habitación adaptada de forma exclusiva como estudio de producción privada. Durante toda la década de 1890, el artista sostuvo un vínculo comercial preferente con la Krasoumná jednota, la Sociedad de Bellas Artes de Praga, enviando piezas de manera sistemática a sus salones anuales y sirviéndose de sus canales de venta para la colocación de lienzos de gran envergadura como "La mujer ahogada", concluida en 1893, adquirida de forma directa por la Galería Moderna del Reino de Bohemia tras prolongadas negociaciones sobre los precios fijados en el catálogo oficial de la sociedad.
Hacia finales de siglo, Schikaneder amplió sus operaciones comerciales al suscribir contratos de exclusividad para la reproducción gráfica con el editor Jan Štenc, propietario de los talleres fotomecánicos más avanzados de la ciudad y fundador de la revista especializada Umění, una alianza comercial que permitió la distribución a gran escala de sus escenas urbanas mediante grabados y fototipias destinadas al consumo de los hogares de la burguesía comercial emergente. Al mismo tiempo, el pintor mantuvo una separación tajante respecto a los colectivos de vanguardia rupturista de la época, como la Secesión de Praga, declinando los ofrecimientos para formar parte de sus comités directivos y prefiriendo concentrar sus ventas en redes de coleccionistas industriales privados de las ciudades de Praga y Pilsen, lo que provocó tensiones con los críticos adscritos al modernismo radical centroeuropeo.
A partir del año 1911, los métodos de producción y la organización logística de Schikaneder sufrieron una modificación geográfica radical, reduciendo sus compromisos institucionales en Praga para volcarse en proyectos financiados por los fondos de inversión privados que había acumulado en las décadas previas. Entre los años 1912 y 1914, el pintor planeó y sufragó de manera autónoma una serie de desplazamientos de larga distancia hacia las regiones costeras del norte de Europa, fijando periodos de residencia temporal prolongada en la isla de Helgoland, situada en el Mar del Norte, así como en diversos enclaves pesqueros de la costa báltica pertenecientes al Imperio Alemán. La preparación de estos viajes exigía una compleja gestión de transporte previo, remitiendo por vía férrea cajas con bastidores de gran formato, lienzos gruesos tratados contra la humedad marina y gamas de pigmentos al óleo estables para soportar el trabajo directo en los muelles, malecones y zonas portuarias bajo condiciones climáticas adversas de niebla densa.
El comienzo de la Primera Guerra Mundial en el verano de 1914 bloqueó de forma absoluta sus rutas internacionales de transporte, confinándolo a trabajar dentro de su estudio cerrado en Praga, donde se dedicó a elaborar composiciones de topografía histórica urbana basadas en planos catastrales antiguos y crónicas de archivo sobre las zonas del gueto judío que habían sido demolidas durante el proceso de saneamiento municipal de las décadas anteriores. Tras el colapso de la monarquía habsbúrguica y la posterior fundación de la República de Checoslovaquia, Schikaneder presentó formalmente su solicitud de retiro de las funciones de enseñanza en la Escuela de Artes Aplicadas en el año 1922, una petición aprobada por el nuevo Ministerio de Educación de la república, que le asignó una pensión de jubilación vitalicia acorde a sus treinta y siete años de servicios académicos prestados. El matrimonio trasladó entonces todos sus enseres domésticos a su última vivienda documentada en el distrito praguense de Smíchov, donde el artista continuó pintando de forma aislada a partir de los apuntes y estudios de oleaje tomados en su última estancia en Helgoland realizada en el verano de 1921.
Jakub Schikaneder falleció el 15 de noviembre de 1924 en su residencia de Smíchov, siendo inhumado días después en el Cementerio de Vinohrady. La testamentaría y la administración legal de todos sus bienes remanentes quedaron bajo la gestión exclusiva de su viuda, Emílie Schikanederová, quien tomó la determinación de retener la mayor parte de las obras de la última etapa en el domicilio familiar sin firmar ni inventariar, una acción administrativa que sustrajo estas piezas del mercado secundario durante décadas hasta que los proyectos de catalogación científica de la segunda mitad del siglo XX, desarrollados por la Galería Nacional de Praga y la Galería de Bohemia Occidental en Pilsen, fijaron su autoría definitiva y establecieron el paradero institucional y de conservación actual de los lienzos en las colecciones públicas del Estado checo.